Anschlussprojekte | Sonderprojekte

Förderbeginn 01.07.2023

Funktionalisierung von bakteriellen Proteomen mittels quantitativer Massenspektrometrie

Dr. Christina Ludwig
Technische Universität München
BayBioMS

Prof. Dr. Terence Hwa
University of California, San Diego
Department of Physics, M/C 0374


Molekularbiologische Experimente spielten in den letzten Jahrzehnten bei der Erforschung der Funktion und Regulation von Proteinen eine zentrale Rolle. Dieses Unterfangen hat zu einem umfangreichen Katalog molekularer Aktivitäten in gut untersuchten Modellorganismen geführt. Trotz dieser Fülle an Informationen ist der vereinfachte Ansatz der Addition einzelnen Komponenten nicht in der Lage, den Phänotyp eines Organismus als Reaktion auf genetische oder externe Störungen vorherzusagen. Heutzutage bieten die Omics-Technologien, wie zum Beispiel die Proteomik, eine globale Perspektive auf das wenig verstandene Zusammenspiel von Subsystemen. Darum nutzen wir die Massenspektrometrie-basierte Proteomik, um Einblicke in das globale Verhalten (fast) aller Escherichia coli Proteine als Reaktion auf eine große Anzahl unterschiedlicher Stimuli zu gewinnen. Im Rahmen dieses BaCaTeC-Projekts möchten wir zusammen mit den Spezialisten unseres Partnerlabors (Prof. Hwa) an der University of California San Diego, den Wert von quantitativen Hochdurchsatz-Proteomikdaten für die theoretische Modellierung ganzer Zellen untersuchen. Unser Ziel ist es eine vollständige funktionelle Beschreibung aller bakteriellen Proteinen zu erarbeiten und ein Modell zu entwickeln, welches globale Anpassungsreaktionen vorhersagen kann.