Förderbeginn 01.01.2004

Struktur und Dynamik von RNA-Molekülen - ein kombinierter NMR/FRET-Ansatz

Dr. Dagmar Klostermeier
Universität Bayreuth
Lehrstuhl für Spektroskopie weicher Materie

Dr. Mirko Hennig
The Scripps Research Institute California
Integrative Structural and Computational Biology



Strukturbestimmung mit NMR-Methoden basiert auf Abstandsinformation <0.5 nm. Im Gegensatz dazu können mit FRET Abstände von 1-10 nm gemessen werden. NMR Relaxationsexperimente liefern Information über lokale und globale Dynamik im ps-ns Bereich, wohingegen mit Einzelmolekül-FRET Umwandlungskinetiken von Konformeren auf der ms Zeitskala zugänglich sind. In diesem Projekt wollen wir NMR und FRET Ergebnisse kombinieren, um Struktur und Dynamik von RNA besser zu verstehen. Abstandsinformation beider Methoden sollen gemeinsam zur Strukturverfeinerung genutzt werden, um atomare Auflösung mit Information über globale Konformationen zu vereinen. Ebenso soll dynamische Information beider Methoden kombiniert werden, um eine umfassendere Beschreibung lokaler und globaler Dynamik auf biologisch relevanten Zeitskalen zu erreichen.