Anschlussprojekte | Sonderprojekte

Förderbeginn 01.01.2004

Entwicklung einer Datenbank alternativ gespleißter Exons zur Analyse von alternativen prä-mRNA Spleißen

Prof. Dr. Stefan Stamm
Friedrich-Alexander-Universität Erlangen-Nürnberg
Lehrstuhl für Biochemie und Molekulare Medizin

Dr. Xiang-Dong Fu
University of California, San Diego
Department of Cellular und Molecular Medicine


Die Sequenzierung des menschlichen Genoms hat ergeben, dass alternatives Spleißen eine wichtige Bedeutung zur Herstellung des komplexen menschlichen Genoms aus nur etwa 25.000 Genen hat. Bisher wurden alternative Spleißvorgänge nicht systematisch in Datenbanken erfasst. Die manuelle Annotierung der Datenbanken ist zeitaufwendig und teuer, kann aber wegen der Komplexität von Spleißmustern gegenwärtig nicht durch Computerprogramme ersetzt werden. Gegenwärtig arbeiten Gruppen in Erlangen und San Diego intensiv an der Entwicklung solcher Datenbanken. Um Doppelannotierungen zu verhindern und um einen einheitlichen Standard zu entwickeln, der eine Kompatibilität ermöglicht, wurde diese Zusammenarbeit begründet. Das Ziel ist es, eine einfach zu bedienenden, einheitliche Datenbank zu entwickeln, die von Ärtzen, sowie Wissenschaftlern in Industrie und Forschung verwendet werden kann. Die Datenbank soll zur Analyse der Daten von alternativen Exon-Chip Experimenten verwendet werden.